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微流控技術(shù)在法醫(yī)DNA快速檢驗方面的應(yīng)用

  微流控技術(shù) 

   微流控芯片技術(shù)因其微型化、自動化、高通量、集成化、快速等優(yōu)勢使得實驗室研究產(chǎn)生革命性的變化,并在生物化學(xué)、醫(yī)學(xué)等諸多領(lǐng)域得到廣泛應(yīng)用,但目前還沒有基于微流控芯片技術(shù)的國產(chǎn)全集成自動化DNA分析儀。

   此篇文章為大家講解微流控技術(shù)在法醫(yī)DNA快速檢測方面的研究進展,同時介紹國內(nèi)外全集成式DNA分析的研究狀況。未來,以微流控芯片為主導(dǎo)的全自動、便攜式、集成式、集成化的DNA分析系統(tǒng),將使得法醫(yī)DNA檢驗從實驗室走進案件現(xiàn)場甚至日常生活,實現(xiàn)真正快速即使檢驗。

傳統(tǒng)的法醫(yī)DNA檢測過程包括生物檢才提取、DNA提取和定量、PCR復(fù)合擴增、毛細管電泳等,整個過程大約需8~10h,不僅耗時耗力,需購置特定的實驗儀器,大多步驟以及反應(yīng)之間的轉(zhuǎn)換需手工操作,而且需要專業(yè)人員進行操作。從根本上解決日益緊迫的DNA物證檢驗量、集成化和自動化是必然選擇。從20世紀90年代逐漸興起的微流控芯片技術(shù)具有體積小、樣本和試劑消耗少、分析成本低、分析速度快,易于實現(xiàn)操作流程集成化和自動化等諸多優(yōu)勢,為實現(xiàn)法醫(yī)DNA快速分析開辟了一條新途徑。

諸多學(xué)者從微流控技術(shù)角度出發(fā),對涉及DNA快速檢測,包括芯片DNA提取、芯片PCR擴增、毛細管芯片電泳及集成式芯片等各方面進行了研究。

1、芯片DNA提取技術(shù)

   芯片DNA提取技術(shù)方面,傳統(tǒng)的DNA提取方法需要多次震蕩、離心、轉(zhuǎn)移等,操作費時,不易整合到芯片上,更不適合DNA的快速檢驗。國內(nèi),研究人員應(yīng)用PMMA芯片制作了非填充式DNA提取芯片,從血中提取DNA且能夠滿足后續(xù)PCR的需要。后來國內(nèi)研究人員研究了PDMS芯片DNA微分析系統(tǒng),將磁珠固相提取技術(shù)與微流控芯片相結(jié)合,成功完成大腸桿菌熱裂解、DNA提取至PCR擴增的全過程,為單芯片上集成多功能提供了可能。更有研究者開發(fā)了其他在芯片上的提取方法,例如基于pH誘導(dǎo)的靜電吸附DNA提取、基于UV活化的聚碳酸酯表面的DNA提取、基于納米多孔濾膜的DNA提取。

2、芯片PCR擴增技術(shù)

   PCR芯片根據(jù)其液體流動方式可分為微反應(yīng)腔式PCR芯片和連續(xù)流動式PCR芯片。其中,微反應(yīng)腔PCR芯片實際上是傳統(tǒng)PCR的微型化,將反應(yīng)混合物固定在微反應(yīng)池內(nèi),通過外部對其不斷加熱與制冷來實現(xiàn)溫度循環(huán),該種芯片具有體積小,結(jié)構(gòu)簡單,易于制作成一次性、集成度高、易于整合其他功能芯片的特點。連續(xù)流動式PCR芯片,是將反應(yīng)混合物于3個恒溫區(qū)內(nèi)連續(xù)流動,沒流過3個溫區(qū)即完成一次擴增,具有反應(yīng)速度快、擴增時間短的特點。

    后來研究人員為了實現(xiàn)多個樣本的同時擴增,研究人員在設(shè)計的PMMA多通道擴增芯片上,利用快速DNA酶和紅外擴增系統(tǒng),39min就能夠同時完成最多個樣本的STR擴增,不僅提高了檢測通量,而且縮短了DNA分型時間,同時降低了每個樣本的檢測成本,更體現(xiàn)出微流控技術(shù)在法醫(yī)DNA快速分析的優(yōu)勢。

3、毛細管芯片電泳技術(shù)

   毛細管芯片電泳技術(shù),早期主要集中在芯片毛細管電泳的進樣方式、流體控制及影響分離柱效的因素等基礎(chǔ)性研究工作中。后來,Mathies實驗室搭建了具有4通道的微陣列芯片電泳裝置,在有效分離長度為10cm的芯片上實現(xiàn)9個STR基因座的分離,該裝置的檢測限為25個拷貝。2010年,同一實驗室又開發(fā)出集成PCR擴增的便攜式共聚焦熒火掃描的多通道毛細管電泳檢測平臺,能夠在分離長度為7cm的芯片上同時完成96個樣本的檢測,檢出限為20pmol/L。

目前,芯片毛細管電泳已從實驗研究階段逐步向產(chǎn)業(yè)化方向發(fā)展。已能夠?qū)崿F(xiàn)對DNA、RNA、蛋白質(zhì)等高通量的分離分析。

4、集成式芯片

    在集成式芯片研究方面,盡管將法醫(yī)DNA分析全流完成集成于一體存在很大挑戰(zhàn),但是一些研究者已嘗試利用微流控系統(tǒng)將各種步驟與芯片毛細管電泳相結(jié)合。

    2014年,Delphine等在前期工作基礎(chǔ)上,成功研發(fā)出用于法醫(yī)個體識別的全集成式的微流控芯片,該芯片由塑料制成,包括基因分型全過程:一種獨特酶反應(yīng)液的DNA制備、紅外非接觸式PCR擴增及高分辨率的電泳分離,并證明了2h能夠從口腔拭子和FTA卡樣本得到18個STR基因座分型,且檢測結(jié)果和傳統(tǒng)方法完全一致。

    近幾年微流控芯片技術(shù)在DNA快速檢測方面取得了突破性進展,引起產(chǎn)業(yè)界的很大關(guān)注,國外推出的3款商業(yè)化的快速檢測儀器,以滿足法醫(yī)DNA現(xiàn)場即時檢驗的需求,但國內(nèi)尚屬空白,因此,我們期待我國科研人員加強產(chǎn)業(yè)化意識,積極革新技術(shù),自主開發(fā)一款適于我國DNA快速檢驗的低成本、高通量、便攜式的現(xiàn)場快速檢測儀器,以提升在全集成式DNA快速檢驗的國際競爭力。



標簽:   微流控技術(shù) 微流控芯片